绿色食品认证主要包括以下四个方面：

一是绿色食品产地环境标准，分别对绿色食品产地的空气质量、农田灌溉水质量、畜禽养殖用水质量、渔业水质量和土壤环境的质量的各项指标、浓度限值做了明确规定；

二是绿色食品生产技术标准，包括两部分：一部分是对生产过程中的投入品如农药、肥料、饮料和食品添加剂等生产资料使用方面的规定，另一部分是针对具体种养殖对象的生产技术规程；

三是绿色食品产品标准，对初级农产品和加工产品分别制定相应的感官、理化和生物学要求，例如前面谈到的蔬菜标准；

四是绿色食品标志使用、包装及贮运标准，为确保绿色食品产后在包装运输中不受污染，制定了相应的标准。所有申报企业，其产地环境、生产过程、产品质量和包装和运输等全部符合相应的绿色食品标准要求，才能获得绿色食品标志使用权。这种完整的标准体系和认证过程真正体现了“全程质量控制”的理念。目前农业部颁布的绿色食品标准共计９０项，其中通则类标准有 10项，产品标准有80项。